Brindisi Airport har en terminal som hanterar alla flyg till alla destinationer.

Incheckningsdiskarna ligger på bottenvåningen till höger, medan ankomsthallen ligger på bottenvåningen till höger. Säkerhetskontrollen och transitområdet ligger på 1:a våningen, dit man kommer via rulltrappor och hissar.

Terminalen är mycket liten och under sommarhalvåret är det ofta trångt och få sittplatser. Var på flygplatsen helst 2 timmar före avgång. Denna tid kommer alltid att vara tillräcklig.